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Craif、尿中cfDNAメチル化解析による膵がん予測モデルの研究成果を発表

Craif株式会社は、第85回日本癌学会学術集会において、国内多施設の研究者らと共同で行った尿中cfDNAメチル化解析を用いた膵がん予測モデル構築に関する研究成果を発表した。発表演題は「Urinary cfDNA methylation as a non-invasive biomarker for pancreatic cancer detection in high-risk individuals(ハイリスク群における膵がん早期発見に向けた非侵襲的尿中cfDNAメチル化解析の有用性)」である。痛みのない尿検査により、膵がんハイリスク群から疾患を識別するモデルを構築し、その有用性を検証した。

膵がんハイリスク群を対象とした研究の背景

膵がん(PaC)は5年生存率が約13%と難治性の高いがんである一方、腫瘍径10mm未満の超早期に発見できれば5年生存率は約80%まで向上するとされている。しかし、初期症状に乏しいため早期発見が困難であり、無症状の一般住民を対象としたスクリーニングは偽陽性率が高く現実的ではないという課題があった。

そこで本研究では、慢性膵炎、IPMN(膵管内乳頭粘液性腫瘍)、糖尿病などの「膵がんハイリスク(HR)群」に焦点を当てた。痛みがなく簡便に繰り返し採取可能な尿中遊離DNA(cfDNA)メチル化解析に着目し、自宅で定期モニタリングが可能な非侵襲的識別モデルの構築と実用性の検証が行われた。

18個のマーカーを用いた機械学習モデルで高い識別能を実証

本研究では、ハイリスク患者(86例)、膵がん患者(48例)、健常者(33例)の計167例の尿検体(約12mL)からcfDNAを抽出し、RRBS(Reduced Representation Bisulfite Sequencing)法を用いて高深度ゲノム解析を実施した。

膵がん群とハイリスク対照群の間で有意な差を示した18個のメチル化マーカーに着目して機械学習モデル(教師ありモデル)を構築したところ、内部Holdout群および初期検証群においてAUC 0.795〜0.860の高い精度を達成した。

さらに、正解ラベルを用いない「教師なし進行度スコア」との比較解析を実施したところ、82%以上の高い判定一致率を示した。これにより、計算手法に依存せず、病態の進行に沿った生物学的シグナルが捕捉されていることが確認されたとしている。

共同研究機関と今後の展望

本研究は、国内の複数医療機関との共同研究として実施された。共同研究機関(順不同)は以下の通りである。

  • 仙台オープン病院
  • 交雄会新さっぽろ病院
  • 淡海医療センター
  • 藤枝市立総合病院
  • ともながクリニック
  • 岡山市立市民病院

今後は、尿中に存在する超短鎖cfDNAを高効率に回収する抽出プロトコルの導入や、ターゲットメチル化パネルへの移行を進める方針である。背景ノイズの抑制と腫瘍シグナルの強調を両立させたアッセイの最適化を図り、ハイリスク群モニタリングの早期臨床応用を目指すとしている。

なお、発表が行われた第85回日本癌学会学術集会の概要は以下の通りである。

  • 開催期間:2026年 9月24日(木)~2026年 9月26日(土)
  • 開催地:国立京都国際会館 (京都府京都市)
  • 公式ホームページ:https://www.c-linkage.co.jp/jca2026/

Craif株式会社について

Craif株式会社は、がん早期発見に取り組む2018年創業のバイオAIスタートアップである。独自の解析技術基盤「NANO IP®︎(NANO Intelligence Platform)」とAI技術を融合し、次世代検査の研究・開発や尿がん検査「マイシグナルシリーズ」を提供している。

  • 社名:Craif株式会社(読み:クライフ、英語表記:Craif Inc.)
  • 代表者:代表取締役 小野瀨 隆一
  • 設立:2018年5月
  • 資本金:1億円(2024年3月1日現在)
  • 本社:東京都新宿区新小川町8-30 THE PORTAL iidabashi B1F
  • URL:https://craif.com/

本記事はCraif株式会社の発表をもとに作成。

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